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【R>>aplot】装扮你的ggplot2

科研搬砖日常,往往需要将各种图进行拼接,常用的组合包有patchwork、cowplot和gridExtra等。

科研搬砖日常,往往需要将各种图进行拼接,常用的组合包有patchworkcowplotgridExtra等。但是这几款都是类似将图片进行拼接,图与图之间的关系是平等的,尽管可通过调整参数突出主图,但参数相对较多,不好记忆;而aplot正好能解决对主图注释这一痛点。下面就来学习下吧。

核心函数:

  • insert_left() insert_right() insert_top() insert_bottom()

  • is.ggtree()

  • plot_list()

  • xlim2() ylim2()

  • xrange() yrange()

1.核心函数

1.1 insert_**()

rm(list = ls()) library(ggplot2) library(aplot) p

【R>>aplot】装扮你的ggplot2

ap % insert_top(p2,height = 0.3) %>% insert_right(p3,width = 0.1) ap

【R>>aplot】装扮你的ggplot2

1.2 xlim2

p1

【R>>aplot】装扮你的ggplot2

p2+xlim2(p1)

【R>>aplot】装扮你的ggplot2
2.实战一:heatmap

rm(list = ls()) pacman::p_load(tidyverse,ggtree,aplot,reshape,ggExtra) d % data.frame() rownames(d) % insert_left(phr,width = .3) %>% insert_right(pp,width = .3) %>% insert_right(g,width = .4) %>% insert_top(pc,height =.1) %>% insert_top(phc,height = .2)

【R>>aplot】装扮你的ggplot2

看图确实让人感觉眼花缭乱的,但逻辑比较清晰,就是先用ggplot2绘制所有图,然后通过aplot将这些图放在主图的周围。

3.实战二:散点图+边际密度图

rm(list = ls()) library(ggsci) pp % insert_right(y,width = .2) %>% insert_top(x,height = .3)

【R>>aplot】装扮你的ggplot2

还可以用ggExtra包直接展示

library(ggExtra) p

【R>>aplot】装扮你的ggplot2

参考链接:

1.R中的图片注释神包aplot

2.aplot: Decorate a ‘ggplot’ with Associated Information


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